Tujuan penilitian ini adalah untuk menghasilkan CD interaktif berbasis macromedia flash sebagai media pembelajaran di MA Matholi’ul Huda Jepara khususnya pada mata pelajaran Biologi istem eproduksi manusia dan menganalisis pengaruh pengembangan CD interaktif berbasis macromedia flash sistem reproduksi manusia terhadap meningkatkan pemahaman konsep dan berpikir kreatif siswa. Penelitian menggunakan metode penelitian R & D dengan langkah sebagai berikut; pengumpulan data,pembuatan produk awal, penilaian pakar, revisi 1, uji coba lapangan, revisi 2, penilaian pakar, (produksi masal).  Hasil penelitian dari pakar  menunjukan skor 81,25% dengan keterangan layak untuk digunakan di MA Matholi’ul Huda Jepara dan skor 93 %  dari angket ketertarikan siswa. Hasil penelitian di kelas XI IPA 1 menunjukkan  analisis berfikir kreatif mendapat t hitung – 53,548, analisis pemahaman konsep siswa mendapat t hitung -75,836, menunjukan bahwa berfikir kreatif dan pemahaman konsep siswa meningkat, maka hipotesis diterima, artinya terdapat peningkatan berfikir kreatif dan pemahaman kosep siswa menggunakan media pembelajaran CD interaktif.  Kata Kunci : CD interaktif, pemahaman konsep, berpikir kreatif