Artikel ini mengulas masalah perencanaan dan penganggaran merupakan sebagian kecil siklus pengelolaan keuangan negara di Indonesia. IAIN Madura sebagai salah satu instansi pemerintah dan bagian dari Perguruan Tinggi Keagamaan Islam Negeri (PTKIN) di bawah Kementerian Agama Republik Indonesia terus menerus berupaya meningkatkan mutu pengelolaan keuangan negara di tengah dinamika perekonomian bangsa melalui proses penyusunan perencanaan dan penganggaran. Tujuan kajian ini adalah untuk mengetahui tahapan perencanaan dan penganggaran di IAIN Madura serta menganalisis dari sudut pandang keuangan negara. Metode penelitian menggunakan pendekatan kualitatif deskriptif. Pengambilan data melalui observasi dan wawancara mendalam dengan pihak berkepentingan. Data yang digunakan adalah dokumen perencanaan dan penganggaran berupa dokumen rencana strategis, rencana kerja dan DIPA, RKA-K/L. Hasil penelitian menunjukkan bahwa IAIN Madura dalam proses perencanaan dan penganggaran telah mengikuti kaidah dan peraturan perundangan yang berlaku. Namun masih terdapat program dan kegiatan yang perlu menjadi prioritas dan diselaraskan dengan rencana strategis dan rencana kerja tahunan Institut dan belum tersosialisasikan kepada warga kampus, sehingga direkomendasikan kepada pimpinan Institut untuk merumuskan kebijakan yang dapat diakses oleh unit kerja terkait, berupa penyusunan standar operasional prosedur (SOP) dan melakukan distribusi informasi berupa sosialisasi rencana strategis dan arah kebijakan Institut kepada seluruh civitas akademika serta program dan kegiatan unit kerja dilingkungan IAIN Madura fokus pada penyelarasan terhadap rencana strategis Institut.