Phân tích in silico gen kháng kháng sinh và sàng lọc ảo chất ức chế gen kháng kháng sinh ở Pseudomonas aeruginosa
Abstract
Kháng kháng sinh (KKS) là mối đe dọa sức khỏe cộng đồng và ảnh hưởng lớn đến con người. Pseudomonas aeruginosa (PA) là tác nhân gây ra nhiều bệnh nhiễm trùng và tỉ lệ xuất hiện kháng kháng sinh ở vi khuẩn này ngày càng gia tăng. Nghiên cứu này phân tích tần số xuất hiện gen KKS ở PA, từ đó tiến hành sàng lọc chất ức chế gen KKS có tần số xuất hiện cao nhất bằng phương pháp sàng lọc ảo in silico. Phân tích 327 trình tự bộ gen PA cho thấy blaPAO là gen KKS có tần số xuất hiện cao nhất. Sử dụng blaPAO làm mục tiêu, quá trình sàng lọc ảo được thực hiện với 2776 hợp chất có nguồn gốc thiên nhiên. Kết quả sàng lọc được ba hợp chất có tên lần lượt là Apilimod, CHEMBL1542212, TMP-195 là chất ức chế tiềm năng đối với AmpC-β-lactamase. Phân tích dược động học cho thấy 3 hợp chất trên phù hợp với yêu cầu để làm thuốc vì vậy có thể được phát triển thành chất hỗ trợ điều trị KKS sau khi xác nhận bằng các nghiên cứu thực nghiệm.